申报和承担国家自然科学基金项目，是高校支撑科学研究、学位点建设和学科发展的最重要部分，也是高校提升知名度和扩大影响力的重要抓手和基本切入点。按照“科研强校”战略和本所发展目标的要求，国土资源所高度重视国家自然科学基金项目的申报工作。2011年1月初，本所专门召开了国家自然科学基金项目申报部署和动员会，会后相关教师经过2个多月的认真准备，完成了项目申请书。

截止3月20日为止，国土资源所共计申报2011年度国家自然科学基金项目4项，其中，主持申报面上项目3项（杨子生教授1项，雷冬梅副教授1项，李智国讲师1项），合作申报重点项目1项（杨子生教授等）。